Ποια είναι η διαφορά μεταξύ 16s rRNA και 18s RRNA;
Ποια είναι η διαφορά μεταξύ 16s rRNA και 18s RRNA;

Βίντεο: Ποια είναι η διαφορά μεταξύ 16s rRNA και 18s RRNA;

Βίντεο: Ποια είναι η διαφορά μεταξύ 16s rRNA και 18s RRNA;
Βίντεο: RNA δομή, τύποι και λειτουργίες 2024, Νοέμβριος
Anonim

Το κύριο διαφορά μεταξύ διεξαγωγή αναλύσεων με 18S rRNA γονιδιακά δεδομένα αντί για 16S rRNA γονιδιακά δεδομένα (ή δεδομένα ITS) είναι η βάση δεδομένων αναφοράς που χρησιμοποιείται για την επιλογή OTU, τις ταξινομικές εκχωρήσεις και το κτήριο ευθυγράμμισης που βασίζεται σε πρότυπο, καθώς πρέπει να περιέχει ευκαρυωτικές ακολουθίες.

Λαμβάνοντας υπόψη αυτό, γιατί χρησιμοποιείται το γονίδιο 16s rRNA για ταυτοποίηση;

ο Γονίδιο ριβοσωμικού RNA 16S κωδικοποιεί το συστατικό RNA της υπομονάδας 30S του βακτηριακού ριβοσώματος. Λόγω της πολυπλοκότητας του υβριδισμού DNA-DNA, Γονίδιο 16S rRNA αλληλουχία είναι μεταχειρισμένος ως εργαλείο για να αναγνωρίζω βακτήρια σε επίπεδο είδους και βοηθούν στη διαφοροποίηση μεταξύ στενά συγγενών βακτηριακών ειδών [8].

Επιπλέον, οι ευκαρυώτες έχουν 16s rRNA; ο 16S rRNA γονίδιο υπάρχει σε όλα τα βακτήρια και μια σχετική μορφή εμφανίζεται σε όλα τα κύτταρα, συμπεριλαμβανομένων αυτών των ευκαρυωτες.

Επίσης το ερώτημα είναι, τι είναι το rRNA 18s και 28s;

ο 28S / 18S ριβοσωμικό RNA αναλογία χρησιμοποιείται συχνά για την αξιολόγηση της ποιότητας του ολικού RNA που καθαρίζεται από οποιοδήποτε δεδομένο δείγμα. Στους ανθρώπους, 28S rRNA έχει ~5070 νουκλεοτίδια και 18S έχει 1869 νουκλεοτίδια, που δίνει α 28S / 18S αναλογία ~2,7. Ενα ψηλό 28S / 18S Ο λόγος είναι μια ένδειξη ότι το καθαρισμένο RNA είναι άθικτο και δεν έχει αποικοδομηθεί.

Τι είναι η αλληλουχία 16s rRNA;

16S rRNA γονίδιο αλληλουχία Η ανάλυση είναι μια τυπική μέθοδος στην ταξινόμηση και ταυτοποίηση βακτηρίων και βασίζεται στην ανίχνευση αλληλουχία διαφορές (πολυμορφισμοί) στις υπερμεταβλητές περιοχές του 16S rRNA γονίδιο που υπάρχει σε όλα τα βακτήρια.

Συνιστάται: