Βίντεο: Πώς συναρμολογούνται τα contigs σε ικριώματα;
2024 Συγγραφέας: Miles Stephen | [email protected]. Τελευταία τροποποίηση: 2023-12-15 23:35
Κατά τη δημιουργία ενός σχεδίου γονιδιώματος, οι μεμονωμένες αναγνώσεις του DNA είναι πρώτες συναρμολογούνται σε contigs , τα οποία, από τη φύση τους συνέλευση , έχουν κενά μεταξύ τους. Το επόμενο βήμα είναι προς το στη συνέχεια γεφυρώστε τα κενά μεταξύ αυτών contigs να δημιουργώ ένα ικρίωμα . Αυτό μπορεί να γίνει χρησιμοποιώντας είτε οπτική χαρτογράφηση είτε αλληλουχία ζεύγους mate.
Παρομοίως, μπορείτε να ρωτήσετε, τι είναι τα contigs και τα ικριώματα;
ΕΝΑ ικρίωμα είναι ένα τμήμα της αλληλουχίας του γονιδιώματος που ανακατασκευάστηκε από κλώνους κυνηγετικού όπλου με τελική αλληλουχία. Σκαλωσιές αποτελούνται από contigs και κενά. ΕΝΑ contig είναι ένα συνεχόμενο μήκος γονιδιωματικής αλληλουχίας στην οποία η σειρά των βάσεων είναι γνωστή σε υψηλό επίπεδο εμπιστοσύνης. Σε ορισμένες περιπτώσεις, σκαλωσιές μπορεί να επικαλύπτονται.
Επίσης, τι είναι το contigs στη βιοπληροφορική; ΕΝΑ contig (από συνεχόμενο) είναι ένα σύνολο επικαλυπτόμενων τμημάτων DNA που μαζί αντιπροσωπεύουν μια συναινετική περιοχή του DNA. Contigs μπορεί επομένως να αναφέρεται τόσο σε αλληλοκαλυπτόμενη αλληλουχία DNA όσο και σε επικαλυπτόμενα φυσικά τμήματα (θραύσματα) που περιέχονται σε κλώνους ανάλογα με το πλαίσιο.
Από αυτή την άποψη, πώς συναρμολογούνται τα contigs;
Το σύνολο της αλληλοκαλυπτόμενης αλληλουχίας DNA των θραυσμάτων DNA είναι γνωστό ως α contig . Contig Η χαρτογράφηση είναι μια διαδικασία με την οποία επικαλύπτονται οι κλώνοι συναρμολογημένο για την αλληλουχία αυτής της επικάλυψης. Αυτό περιλαμβάνει τη διευθέτηση του contigs κατά σειρά και προσανατολισμό. Κλώνος contigs μπορεί να γίνει αυτόματα συναρμολογημένο χρησιμοποιώντας τις BAC-end ακολουθίες τους.
Γιατί είναι σημαντικά τα contigs;
Contig η συναρμολόγηση είναι μια σπουδαίος βήμα στη συναρμολόγηση του γονιδιώματος. Για τη χαρτογράφηση, συναρμολογούνται επικαλυπτόμενοι κλώνοι για την αλληλουχία που επικαλύπτονται. Κάθε θραύσμα κλωνοποιείται σε ένα φορέα και προσδιορίζεται η αλληλουχία και από τα δύο άκρα για να παραχθεί ένα μήκος αλληλουχίας περίπου 600-700 bp. Η αλληλουχία και από τα δύο άκρα του θραύσματος DNA ονομάζεται άκρο ζεύγους.
Συνιστάται:
Πώς προβλέπετε εάν μια αντίδραση είναι ενδόθερμη ή εξώθερμη;
Εάν το επίπεδο ενέργειας των αντιδρώντων είναι υψηλότερο από το επίπεδο ενέργειας των προϊόντων, η αντίδραση είναι εξώθερμη (έχει απελευθερωθεί ενέργεια κατά τη διάρκεια της αντίδρασης). Εάν το ενεργειακό επίπεδο των προϊόντων είναι υψηλότερο από το ενεργειακό επίπεδο των αντιδρώντων είναι μια ενδόθερμη αντίδραση
Πώς είναι παρόμοιες οι κατολισθήσεις και οι λασποροές Πώς διαφέρουν;
Η βαρύτητα προκαλεί κινήσεις μάζας. Οι κατολισθήσεις, οι λασποροές, οι ερπυσμοί και οι πλαγιές είναι παράγοντες διάβρωσης. Οι κατολισθήσεις περιέχουν μόνο βράχους και χώμα, ενώ οι λασποροές περιέχουν βράχους, χώμα και υψηλό ποσοστό νερού
Πώς πήραν το όνομά τους οι οργανικές ενώσεις Πώς σχετίζεται η λέξη με τη σημασία της;
Πώς συνδέεται η λέξη με τη σημασία της; Το Organic Compounds πήρε το όνομά του από τον αριθμό των δεσμών άνθρακα. Η λέξη σχετίζεται με την έννοια γιατί έχει να κάνει με δεσμούς σε άτομα άνθρακα σε οργανικές ενώσεις
Πώς έμοιαζε το DNA συσχετίζει τη χημική του δομή με το πώς φαίνεται όταν πολλά από αυτά είναι συσσωματωμένα μεταξύ τους;
Συσχετίστε τη χημική του δομή με το πώς φαίνεται όταν συγκεντρώνονται πολλά από αυτά. Το DNA έμοιαζε με ιστούς αράχνης. Το DNA ήταν διαλυτό στο ρυθμιστικό διάλυμα εκχύλισης DNA, έτσι δεν μπορούσαμε να το δούμε. Όταν αναδεύτηκε στην αιθανόλη, μαζεύτηκε και σχημάτισε όλο και πιο παχύρρευστα νήματα αρκετά μεγάλα για να φαίνονται
Σε ποια κατεύθυνση συναρμολογούνται τα νουκλεϊκά οξέα;
Όλη η σύνθεση RNA και DNA, τόσο κυτταρική όσο και ιική, προχωρά στην ίδια χημική κατεύθυνση: από το 5' (φωσφορικό) άκρο στο άκρο 3' (υδροξυλικό) (βλ. Εικόνα 4-13). Οι αλυσίδες νουκλεϊκών οξέων συναρμολογούνται από 5' τριφωσφορικά ριβονουκλεοσίδια ή δεοξυριβονουκλεοζίτες